MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 102045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	CAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783780
2	NC_013716	ATT	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783780
3	NC_013716	ACC	4	12	193	204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783780
4	NC_013716	CGG	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
5	NC_013716	CAGG	2	8	396	403	25 %	0 %	50 %	25 %	283783781
6	NC_013716	ACCA	2	8	442	449	50 %	0 %	0 %	50 %	283783781
7	NC_013716	TGG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783781
8	NC_013716	GAT	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783781
9	NC_013716	CGG	2	6	477	482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
10	NC_013716	CTG	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
11	NC_013716	CTG	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
12	NC_013716	CGC	2	6	669	674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
13	NC_013716	CAT	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783781
14	NC_013716	GC	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
15	NC_013716	CCA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783781
16	NC_013716	CTG	2	6	772	777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
17	NC_013716	CCG	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
18	NC_013716	CGC	3	9	834	842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
19	NC_013716	GC	3	6	841	846	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
20	NC_013716	CCG	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
21	NC_013716	TGG	2	6	908	913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783781
22	NC_013716	ATT	2	6	935	940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783781
23	NC_013716	CCG	2	6	941	946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
24	NC_013716	GCC	2	6	955	960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
25	NC_013716	GC	3	6	966	971	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
26	NC_013716	GCT	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
27	NC_013716	CAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783781
28	NC_013716	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
29	NC_013716	GC	3	6	1309	1314	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
30	NC_013716	GTA	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783781
31	NC_013716	TCG	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
32	NC_013716	GCGCCC	2	12	1412	1423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
33	NC_013716	GC	3	6	1425	1430	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
34	NC_013716	CTG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
35	NC_013716	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	283783781
36	NC_013716	GC	4	8	1573	1580	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
37	NC_013716	CTC	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783781
38	NC_013716	GGT	3	9	1632	1640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783781
39	NC_013716	CCA	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783781
40	NC_013716	CGG	2	6	1731	1736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
41	NC_013716	CGG	2	6	1740	1745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
42	NC_013716	AGC	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783781
43	NC_013716	CAG	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783781
44	NC_013716	GCT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
45	NC_013716	GGC	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
46	NC_013716	CCAG	2	8	1979	1986	25 %	0 %	25 %	50 %	283783781
47	NC_013716	ACC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783781
48	NC_013716	GCG	3	9	2095	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
49	NC_013716	CTG	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
50	NC_013716	TGA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783781
51	NC_013716	CT	3	6	2269	2274	0 %	50 %	0 %	50 %	283783781
52	NC_013716	TGA	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783781
53	NC_013716	GATG	2	8	2340	2347	25 %	25 %	50 %	0 %	283783781
54	NC_013716	GCT	2	6	2358	2363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
55	NC_013716	TGA	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783781
56	NC_013716	GCC	2	6	2500	2505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783781
57	NC_013716	TGA	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783781
58	NC_013716	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783781
59	NC_013716	TAT	2	6	2662	2667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783781
60	NC_013716	GCCGCT	2	12	2670	2681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283783781
61	NC_013716	TGC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783781
62	NC_013716	ACG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783781
63	NC_013716	CGG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783781
64	NC_013716	GCG	2	6	2841	2846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783782
65	NC_013716	GGC	2	6	2894	2899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783782
66	NC_013716	ACCA	2	8	2916	2923	50 %	0 %	0 %	50 %	283783782
67	NC_013716	CGT	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783782
68	NC_013716	TGG	2	6	3097	3102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783782
69	NC_013716	ATGA	2	8	3105	3112	50 %	25 %	25 %	0 %	283783782
70	NC_013716	CTG	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783782
71	NC_013716	GCA	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783782
72	NC_013716	TGA	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783782
73	NC_013716	CAT	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783782
74	NC_013716	CAGC	2	8	3260	3267	25 %	0 %	25 %	50 %	283783782
75	NC_013716	TGA	2	6	3281	3286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783782
76	NC_013716	CGG	2	6	3328	3333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783782
77	NC_013716	GC	4	8	3336	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	283783782
78	NC_013716	GGC	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783782
79	NC_013716	GGC	2	6	3440	3445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783782
80	NC_013716	TGA	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783782
81	NC_013716	GC	3	6	3535	3540	0 %	0 %	50 %	50 %	283783782
82	NC_013716	CTGG	2	8	3620	3627	0 %	25 %	50 %	25 %	283783782
83	NC_013716	CGG	2	6	3682	3687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783782
84	NC_013716	TAAT	2	8	3705	3712	50 %	50 %	0 %	0 %	283783782
85	NC_013716	GCA	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783783
86	NC_013716	GC	3	6	3938	3943	0 %	0 %	50 %	50 %	283783783
87	NC_013716	CGG	2	6	4037	4042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783783
88	NC_013716	GCG	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783783
89	NC_013716	GCC	2	6	4125	4130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783783
90	NC_013716	CGT	2	6	4166	4171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783783
91	NC_013716	CG	3	6	4183	4188	0 %	0 %	50 %	50 %	283783783
92	NC_013716	GGC	2	6	4230	4235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783783
93	NC_013716	CTG	2	6	4365	4370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783783
94	NC_013716	AGG	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783783
95	NC_013716	CGG	2	6	4471	4476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783783
96	NC_013716	GCT	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783783
97	NC_013716	CGC	2	6	4520	4525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783783
98	NC_013716	AGG	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783783
99	NC_013716	GATG	2	8	4610	4617	25 %	25 %	50 %	0 %	283783783
100	NC_013716	AGCC	2	8	4620	4627	25 %	0 %	25 %	50 %	283783783
101	NC_013716	TAA	2	6	4628	4633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783783
102	NC_013716	CG	3	6	4639	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	283783783
103	NC_013716	GGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783783
104	NC_013716	GCC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783783
105	NC_013716	CCA	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783783
106	NC_013716	CGG	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783783
107	NC_013716	AG	3	6	4859	4864	50 %	0 %	50 %	0 %	283783783
108	NC_013716	GCT	2	6	4931	4936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783783
109	NC_013716	CGC	2	6	4961	4966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783783
110	NC_013716	TGA	3	9	4978	4986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783783
111	NC_013716	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783784
112	NC_013716	GCT	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783784
113	NC_013716	ATG	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783784
114	NC_013716	TCA	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783784
115	NC_013716	CG	3	6	5284	5289	0 %	0 %	50 %	50 %	283783784
116	NC_013716	T	6	6	5291	5296	0 %	100 %	0 %	0 %	283783784
117	NC_013716	TCA	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783784
118	NC_013716	CAC	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783784
119	NC_013716	GCC	2	6	5439	5444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783784
120	NC_013716	ATCAC	2	10	5469	5478	40 %	20 %	0 %	40 %	283783784
121	NC_013716	TGC	2	6	5601	5606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783784
122	NC_013716	GC	3	6	5690	5695	0 %	0 %	50 %	50 %	283783784
123	NC_013716	GCG	2	6	5788	5793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783784
124	NC_013716	CAG	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783784
125	NC_013716	AATCAG	2	12	5906	5917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	283783784
126	NC_013716	GCT	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783785
127	NC_013716	CAG	3	9	6131	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783785
128	NC_013716	A	6	6	6290	6295	100 %	0 %	0 %	0 %	283783785
129	NC_013716	CAAA	2	8	6343	6350	75 %	0 %	0 %	25 %	283783785
130	NC_013716	ATC	2	6	6351	6356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783785
131	NC_013716	CGC	2	6	6371	6376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783785
132	NC_013716	TGCC	2	8	6424	6431	0 %	25 %	25 %	50 %	283783785
133	NC_013716	CGT	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783785
134	NC_013716	CAG	2	6	6461	6466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783785
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259	NC_013716	AAG	2	6	12518	12523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783790
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391	NC_013716	GAT	2	6	19920	19925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783796
392	NC_013716	TCC	2	6	19932	19937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783796
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499	NC_013716	CAG	2	6	25370	25375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783800
500	NC_013716	GAA	2	6	25418	25423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783800

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